Emre Şen, Bilkent Üniversitesi’nde 8 yıl sürdürdüğü piyano eğitimi boyunca BASO (Bilkent Akademik Senfoni Orkestrası) eşliğinde konserler ve resitaller vermiştir. 1995 yılında kazandığı 5. Roma Uluslararası Piyano Yarışması Birincilik Ödülü Emre Şen’e Avrupa’da bir konser turnesi imkânı sunmuş ve bu dönem İtalya basını onu “Piyanonun Şeytani Meleği” olarak tanımlamıştır. Bursla Paris École Normale de Musique piyano bölümüne girmiş ve “Diplôme Supérieur de Concertiste” sınıfını piyano ve oda müziği dallarında birincilikle bitirmiştir. 1998 yılında bir yıl boyunca New York’ta eğitim gören Emre Şen, lisans diplomasını 2000 yılında Türkiye’ye dönerek Üstün Yetenekler Yasası kapsamında Eskişehir Anadolu Üniversitesi Devlet Konservatuvarı’ndan Sanat Teşvik Ödülü ile almıştır. Lisans üstü eğitimini, Londra’daki Kraliyet Koleji’nde üstünlük derecesi ve konçerto dalında birincilikle tamamlamıştır.